本教材采用案例与传统教学理论相结合的创新性编写模式，在内容和形式上独具匠心，是对高等医药院校特色教材建设的一种积极的尝试和探索。使用本教材组织教学时，既可以按传统模式讲授，把案例作为补充内容，供学生课外阅读讨论；也可以案例为先导，将课堂教学设置到有意义的案例情境中，既丰富了教学内容，又有利于引导学生在互动过程中，去积极探究隐含于案例背后的专业知识和技能，真正实现教学相长，提高教学效率。
根据教育部制定的普通高等学校医药本科药学专业培养目标，全书按药物作用的靶点或药效分类，以药物化学结构与生物活性的关系为主线，讨论了药物的结构和性质、药物与机体的相互作用、药物作用的分子机制、药物在体内转运过程和代谢产物、药物的毒性和副作用、药物的合成路线等，阐述了各类药物的构效关系。在编写上注意药物化学与相关学科的衔接与相互渗透，论述了各类药物的发展，特别是新结构类型药物的研究进展，反映了当代药物化学研究与开发的最新成果。