《医旨绪余》二卷，孙一奎著，其子泰来、朋来参订。该书从基础理论到辨治、方、药诸方面，分78个专题作了辑录和论述。其以“太极”述命门，以无形话三焦，承师说而倡温补，持平议论历代名医长短等，对中医学术的继承、发展有一定的影响。

上卷

 太极图抄引

 太极图说

 不知《易》者不足以言太医论

 问三才所同者于人身何以见之

 命门图说

 上肾水火辨

 《难经正义》三焦评

 附 东垣三焦论

 诊三焦包络

 脉义

 问十二支土多、十二经火多之义

 问手心主

 手足经配合脏腑之义

 问五行金木水火土之义

 问心包络何以不得为藏

 问五行土无定体寄旺四季各一十八日，何长夏一月土又独主之

 问十二经脏腑命名之义

 原呼吸

 论诊法

 证候推移指法

 宗气营气卫气说

 痢与滞下辨

 噎膈翻胃辨

 四时脉说

 问伤寒桂枝汤用桂枝说

 气郁胁痛论

 论痰为津液、脾湿所生，亦有因于火、因于虚、因于气、因于食者，而二陈峻利之剂，不可以概用也

 咳嗽

 哮

 喘

 论汗不可纯作血看，当以气看为妥

 论五郁

 论呕血

 论咳血

 论齿衄

 颤振

 相火篇

 丹溪《相火篇》辨

 泄泻辨

 防暑论

 痿论

 癫狂痫辨

 明癫症

 明狂症

 明痫症

 鼻鼽

 鼻渊

下卷

 胁痛

 腹中水块作痛

 治肾消

 罗太无药戒

 人经脉上下左右前后二十八脉考

 人身有四海说

 删定野山秘抄种子论

 护胎说

 王节斋《本草集要》参芪论

 《洗冤录》载沿身骨节上下联络名目

 《洗冤录》验胎法

 人身内景说

 不执方说

 张刘李朱滑六名师小传

 《医通》节文

 《医通》绪论章

 药性裁成

 论用药

 论人参

 论当归

 论香附

 论半夏

 论黄连

 论诸药

 论五谷

 论五果

 论五菜

 论五畜禽虫之属

 论异类有情丸

 《难经本义》十八难图注辨

 《难经》肺金肝木浮沉说

 《难经》七十五难金不得平木“不”字辨

 《难经》八十一难篇“是病”二字辩

 节抄《灵枢》引

 本神篇

 决气篇

 胀论

 五癃津液别篇

 贼风篇

 妇人无须

 忧恚无言篇

 邪客篇

 大惑篇

 十二经络藏象见证

手太阴肺藏象

手阳明大肠经藏象

足阳明胃经藏象

足太阴脾经藏象

手少阴心经藏象

手太阳小肠经藏象

足太阳膀胱藏象

足少阴肾藏象

手厥阴心包络之经

手少阳三焦之经

足少阳胆藏象

足厥阴肝藏象

督脉

任脉

 附 王好古类集五脏苦欲补泻药味

脏腑泻火药

 附 李东垣药类法象

 药性要旨

 用药升降浮沉补泻法

 五味所用

 药类法象

 标本阴阳论

 五方之正气味

 随证治病药品

用药凡例

 东垣报使

 十二经向导

 十八反