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书名 生物大分子的X射线晶体学(中英文对照)
分类 科学技术-自然科学-生物科学
作者 柯衡明//陈玉祥//蔡继文
出版社 化学工业出版社
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简介
编辑推荐

本书以结构测定的流程为线索,结合作者多年的晶体学研究和应用经验,深入浅出地介绍晶体学基本原理及最新的晶体结构分析技术和方法。本书重点介绍蛋白质晶体培养方法、同晶置换、多波长反常衍射、相位精修、分子置换的基本原理,重原子衍生物制备的基本过程和方法,电子密度图解析,结构模型构建和最后的结构精修。

本书对结构生物学和分子药学工作者具有重要的参考价值。

内容推荐

本书主要介绍了生物大分子X射线衍射晶体学的基本原理,包括蛋白质的纯化和晶体的培养、晶体的表征、X射线衍射原理、蛋白质晶体结构分析的主要方法和手段、重原子衍生物的制备、分子置换法解析晶体结构、蛋白质模型的构建、电子密度图的解析以及结构精修等。本书结合第一作者柯衡明教授多年从事蛋白质晶体结构分析所积累的经验,总结了在蛋白质纯化、蛋白质及其重原子衍生物晶体的培养、数据处理和结构分析过程中常见的问题和解决方法。

本书可作为从事结构生物学研究的科研工作者的参考书和研究生的教材。

目录

1 大分子结构测定概述

 参考文献

2 生物大分子的结晶

 2.1 结晶的理论基础

 2.2 影响结晶的因素

 2.3 结晶方法

 2.4 结晶的实用心得

 2.5 结晶过程的自动化

 参考文献

3 晶体的表征

 3.1 晶系

 3.2 对称性与空间群

 3.3 对称性的矩阵表示

 3.4 晶胞的不对称单位

 3.5 倒易晶胞

 参考文献

4 X射线衍射原理

 4.1 X射线的产生

 4.2 一个电子的散射

 4.3 一个原子对X射线的散射

 4.4 一个分子对X射线的散射

 4.5 衍射的中心对称性

 4.6 布拉格衍射定律

 4.7 爱瓦尔德衍射球

 4.8 衍射空间的对称性

5 帕特森函数

 5.1 相角问题简介

 5.2 帕特森函数

5.2.1 帕特森函数的理论基础

  5.2.2 帕特森图的解析

 参考文献

6 同晶置换

 6.1 同晶置换理论

 6.2 相角计算

 6.3 重原子的最小二乘法精修

 6.4 重原子最大概率精修

 参考文献

7 多波长反常衍射

 7.1 多波长反常衍射的原理

 7.2 反常散射的差异

 7.3 吸收限

 7.4 MAD的实验设计

 7.5 MAD中相位的计算

 参考文献

8 相位优化

 8.1 溶剂平滑法

 8.2 直方图匹配

 8.3 局部或非晶体学对称性平均

 8.4 相位组合

 参考文献

9 重原子衍生物的制备

 9.1 同晶现象

 9.2 溶液中影响重金属结合的原因

  9.2.1 pH值的影响

  9.2.2 缓冲液

  9.2.3 沉淀剂

  9.2.4 重金属浓度、浸泡时间和温度

 9.3 重金属概论

  9.3.1 汞

  9.3.2 铂、金、钯

  9.3.3 铱和锇

  9.3.4 铀酸盐和阳离子试剂

  9.3.5 氙

 9.4 MAD实验用的重原子

 9.5 硒代甲硫氨酰蛋白质突变体的制备

 9.6 硒代甲硫氨酸内切酶NaeⅠ表达的实验设计(Ke's Lab,UNC,August 1998)

  9.6.1 大肠杆菌细胞的增殖

  9.6.2 改良的M9培养基的制备

 参考文献

10 分子置换法

 10.1 引言

 10.2 坐标转换

 10.3 欧拉角和极化角

 10.4 分子置换法原理

 10.5 旋转函数

 10.6 平移函数

 10.7 分子对称性和自旋转函数

 参考文献

11 蛋白质的结构

 11.1 多肽的构象

 11.2 二级结构

 参考文献

12 电子密度图的解析与模型构建

 12.1 电子密度图

 12.2 分辨率与图的质量

13 结构精修

 13.1 判断结构的正确性

 13.2 最小二乘法

 13.3 立体化学限制的最小二乘法精修

 13.4 分子动力学精修法

13.4.1 鲍威尔能量最小化

13.4.2 分子动力学

参考文献

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更新时间:2025/3/1 16:34:05