《本草纲目》全书共52卷，分为16部、60类。收录原有诸家《本草》所载药物共1518种，新增药物374种。对每种药物，以“释名”确定名称；“集解”叙述产地、形态、栽培及采集方法等，“辩疑”、“正误”考订药物品种真伪和纠正历史文献记载的错误；“修治”说明炮炙方法；“气味”、“主治”、“发明”分析药物的性味与功能；“附方”搜集古代医家和民间流传的方剂共11000余首。并附有1100余幅药物的形态图。
本书对了多种版本的《本草纲目》，以面向大从，经济实用为目的，以尽可能展示原着的全貌和完整为前的是，按照原书的编写体例进行了白话精译，并适当地删去了一些怪异难得的品物和一些缺乏科学依据的医方，以利于读者更好地掌握日常饮食养疗的知识。