神话时代，有一群守护希腊女神雅典娜的少年。他们的拳可以划破长空，他们的脚可以碎裂大地，他们被称为“雅典娜的圣斗士”。
古拉杜财团的城户光政在十三年前受艾俄洛斯这托收养了雅典娜的化身沙织并保存人马座的圣衣。后来，城户光政将自己的一百个亲生儿子送往世界各地进行成为圣斗士的训练。其中有十名少年成功地成为了圣斗士，并取得圣衣陆续回到了日本。长大后的沙织代替已故的城户光政举办了银河战争，以此来寻找与圣域中邪恶势力作战的真正的圣斗士，并引出潜藏在黑暗中的邪恶势力。信任教皇的众多圣斗士奉教皇之命前来除掉星矢他们这些青铜圣斗士，并计划抢走人马座的圣衣与沙织。身为雅典娜化身的沙织下定了与圣域的邪恶势力教皇决战的决心。