《脾胃论》全书三卷。卷上为该书的核心部分，尤其是开卷的《脾胃虚实传变论》、《藏气法时升降浮沉补泻之图》和《脾胃胜衰论》三篇，引用大量经文，将该书宗旨、作者意图、基本理论和治法方药加以详细阐述，构建了脾胃学说的理论基础。卷中，主要阐述脾胃病的具体证治，如劳倦所伤、发病时令、补脾升阳、木郁达之、安养心神以及用药与针刺等均有详细的讨论。卷下，重申脾胃病与天地阴阳、升降浮沉的密切关系，实际上是对上、中二卷部分内容的重点阐发，并结合临床实践具体论述各种治疗方法。

脾胃论卷上

脾胃虚实传变论

脏气法时升降浮沉补泻之图

脾胃胜衰论

补脾胃泻阴火升阳汤

肺之脾胃虚论

升阳益胃汤

君臣佐使法

分经随病制方

通气防风汤

羌活胜湿汤

用药宜禁论

《内经》、仲景所说脾胃

脾胃论卷中

气运衰旺图说

饮食劳倦所伤始为热中论

补中益气汤

脾胃虚弱随时为病随病制力

黄芪人参汤

除风湿羌活汤

调中益气汤

长夏湿热胃困尤甚用清暑益气汤论

清暑益气汤

随时加减用药法

肠僻下血论

凉血地黄汤

升阳除湿防风汤

脾胃虚不可妄用吐药论

安养心神调治脾胃论

凡治病当问其所便

胃气下溜、五脏气皆乱、其为病互相出见论

阴病治阳、阳病治阴

三焦元气衰旺

脾胃论卷下

大肠小肠五脏皆属于胃、胃虚则俱病论

脾胃虚则九窍不通论

胃虚脏腑经络皆无所受气而俱病论

胃虚元气不足诸病所生论

忽肥忽瘦论

天地阴阳生杀之理在升降浮沉之间论

阴阳寿天论

五脏之气交变论

阴阳升降论

调理脾胃治验

治法用药若不明升降浮

沉差互反损论

清神益气汤

半夏白术天麻汤

人参芍药汤

麻黄人参芍药汤

升阳散火汤

安胃汤

清胃散

清阳汤

胃风汤

阳明病湿胜自汗论

调卫汤

湿热成痿肺金受邪论

清燥汤

助阳和血补气汤

升阳汤

升阳除湿汤

益胃汤

生姜和中汤

强胃汤

温胃汤

和中丸

藿香安胃散

异功散

饮食伤脾论

五苓散

论饮酒过伤

葛花解酲汤

枳术丸

橘皮枳术丸

半夏枳术丸

木香干姜枳术丸

木香人参生姜枳术丸

和中丸

交泰丸

三棱消积丸

备急丸

神保丸

雄黄圣饼子

蠲饮枳实丸

感应丸

神应丸

白术安胃散

圣饼子

当归和血散

诃梨勒丸

脾胃损在调饮食适寒温

胃风汤

三黄丸

白术散

加减平胃散

散滞气汤

通幽汤

润肠丸

导气除燥汤

丁香茱萸汤

草豆蔻丸

神圣复气汤

脾胃将理法

摄养

远欲

省言箴

脾胃论后序