本书共分两个部分：拓扑学中的子性和数学走进生物大分子序列。
第一部分是一次演讲的纲要。手性就是左右不对称性，是自然界的常见现象，在化学中日益重要。本书介绍了作者和王诗箴教授合作的一个科研课题的来龙去脉。从材料化学家1982年的实验和问题、拓扑学家1986年的回答，提出我们自己的新概念与新问题，解释了所涉及的数学概念，以及关于平面性的经典定理。陈述了我们得到的数学定理，但是略去了逻辑严密的数学证明。值得注意的看点，一是当代数学与自然科学的呼应和互动。二是作者们提出问题、寻找答案的思路，问题的化学背景和几何形象所提供的线索。逻辑并不是故事的主角。
第二部分就一些计算分子生物学问题，来看数学正在走进生物学，并展示其中数学能起什么作用，怎样起作用。讨论了大规模DNA测序时的序列拼接问题，阐述了利用Euler图的数学模型进行DNA序列的准确拼接方法；介绍了序列比对的决定性法——动态规划法，及利用随机性的两种快速方法；介绍了模体搜索的一个决定性算法模型，以及一个利用短串表达序列的模体搜索方法，并对算法成功的概率进行了分析与估计。

拓扑学中的手性———拓扑学与化学结缘
1 引言 003
2 手性的数学定义 006
3 莫比乌斯梯的故事 012
4 标记式手性与图形的平面性 019
5 结束语 025
参考文献 027
数学走进生物大分子序列
6 引言 031
7 基因测序中的故事 034
8 序列比对(alignment) 算法 068
9 模体(motif)搜索的概率方法 085
参考文献 101
附录1 信息熵的概念 104
附录2 优选似然估计 109