《日本古学派之哲学》 （1902年）与 《日本阳明学派之哲学》 （1900年）、《日本朱子学派之哲学》 （1905年）被称为井上“儒学三部曲”，是近代日本儒学史的奠基性著作。
本书将山鹿素行、伊藤仁斋创立的堀川学派、荻生徂徕创立的蘐园学派统称为古学派。井上立足于三派的反朱子学立场，在讨论各自学问特征之余，亦尝试寻找日本古学派产生的内部原因，且有意提取或构筑有利于日本近代国家建设的民族精神要素和德育资源。作为近代日本古学派研究的奠基性著作，此书影响深远，不少观点至今仍有重要意义，但也有不少需要反省的问题。如何给所谓的“日本古学派”一个客观、准确的思想史定位，仍然是当今学界讨论的一个重要话题。

1/序
1/《日本古学派之哲学》三版序
1/叙论
1/第一篇山鹿素行
事迹/3
第二著书/23
第三学说/32
第四批判/67
第五素行关系书类/72
77/第二篇伊藤仁斋及仁斋学派
第一章伊藤仁斋/79
事述附伊藤氏系谱/79
第二著书/97
第三文藻/102
第四学风/106
……