《金匮要略》以内科杂病为主，对外科妇科的病症也有专篇论述。全书3卷，25篇，是我国现存最早的一部关于杂病诊治的专书。《金匮要略》对我国东汉之前丰富的诊疗经验去粗取精，将体虚感受风邪，从经络进入脏腑列为发病的首要原因，强调诊脉时以脏腑经络为辩证重点，并且结合营卫气血、阴阳五行等理论展开论述，依照《黄帝内经》中的“上工治未病”原则，针对诸多疾病提出预防和养生建议。该书记载的温熨、烙法、洗浴法、药摩等外治法，对临床治疗学来说也有着不可磨灭的影响力。《金匮要略》中收录方剂262个，其方剂因精炼严密被后世誉为“众方之祖”，其中不少仍被广泛应用于临床之中。

卷上
脏腑经络先后病脉证第一001
痉湿暍病脉证第二009
百合狐惑阴阳毒病证治第三018
疟病脉证并治第四024
中风历节病脉证并治第五026
血痹虚劳病脉证并治第六032
肺痿肺痈咳嗽上气病脉证治第七038
奔豚气病脉证治第八044
胸痹心痛短气病脉证治第九046
腹满寒疝宿食病脉证治第十050
卷中
五脏风寒积聚病脉证并治第十一058
痰饮咳嗽病脉证并治第十二064
消渴小便不利淋病脉证并治第十三075
水气病脉证并治第十四079
黄疸病脉证并治第十五091
惊悸吐衄下血胸满瘀血病脉证治第十六098
呕吐哕下利病脉证治第十七102
疮痈肠痈浸淫病脉证并治第十八115
趺蹶手指臂肿转筋阴狐疝蚘虫病脉证治第十九118
卷下
妇人妊娠病脉证并治第二十121
妇人产后病脉证治第二十一125
妇人杂病脉证并治第二十二129
杂疗方第二十三137
禽兽鱼虫禁忌并治第二十四141
果实菜谷禁忌并治第二十五148